Уникальная аппаратура для идентификации штаммов особо опасных инфекций появилась в Алматы

К очень нужной в плане обеспечения биологической безопасности населения работе – секвенированию штаммов коллекционных особо опасных и зоонозных инфекций, испокон веку циркулирующих на территории нашей страны, ННЦООИ им. М. Айкимбаева шел давно. Для ясности: секвенирование – это синтез или определение аминокислотной или нуклеотидной последовательности генома, позволяющий вникнуть в суть всего живого на земле.

– Кластерные анализы в Казахстане проводятся не первый год, но лаборатория, о которой идет речь, стала единственной в нашей стране, где можно изготовить диагностические препараты, которые сразу могут идентифицировать штаммы особо опасных инфекций, – сообщила начальник управления инновационных технологий научного центра Алтын Рысбекова.

Этот процесс, по ее словам, был ускорен пандемией COVID-19. Если раньше геномное секвенирование делалось фрагментарно, то появившийся после пандемии в ННЦООИ им. М. Айкимбаева единый секвенатор для нескольких лабораторий позволяет распознавать штаммы зоонозных (передающихся людям от животных) и особо опасных инфекций по их географии – завозные они или же из очага, расположенного на территории Казахстана.

– Для сравнения можно взять еще совсем недавно считавшийся особо опасной инфекцией SARS-CoV-2 (COVID-19), – говорит ученый. – Сейчас его перевели из второй в третью группу опасности, и теперь это просто опасная инфекция из категории завозных. Напомню: на тот момент, когда мир узнал об этой инфекции, еще ни одна страна не была эндемичной (географически расположенной) именно для этого вида коронавируса. Позже благодаря секвенированию начали распознавать другие варианты SARSCoV-2, появляющиеся в разных странах. Так как они не подходили ни одному из известных кластеров, новым штаммам одной и той же инфекции стали давать разные названия – альфа, бета, дельта, гамма и омикрон.

Сейчас специалисты научного центра им. М. Айкимбаева занимаются разработкой тест-систем на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) для диагностики чумы, туляремии, холеры, конго-крымской лихорадки и такой смертельно опасной инфекции, как геморрагическая лихорадка с почечным синдромом, которая в основном выделяется в Туркестанской области, но пока только у животных или же в окружающей среде. Далее идет секвенирование по кластерам, а затем делается статистическая обработка, то есть информационный анализ, исследующий количественные, качественные и географические характеристики штамма.

– Когда происходит вспышка той или иной инфекции, то благодаря возможностям новой лаборатории в течение двух-трех суток мы можем определить – завозной случай с трансграничных территорий (Кыргызстана или России), собственный очаг или же это биооружие, – говорит Алтын Рысбекова. – Кстати, что касается COVID-19, то многие предполагали, что это лабораторный штамм, но потом все-таки ученые из разных стран доказали с помощью секвенирования, что он имеет природное происхождение.

Кластеры на каждую инфекцию идут по отдельности в зависимости от региона, но за счет секвенирования мы можем отличить музейные (коллекционные) штаммы животных, полученные из одного очага, к примеру в середине прошлого века, от свежих.

Особое внимание в новой лаборатории уделяется чуме, по которой Казахстан является самой эндемичной, то есть опасной территорией в СНГ: ее природные очаги имеются на 40% территории страны. Но казахстанские зоологи и эпидемиологи, как сообщила Алтын Рысбекова, каждый год проводят эпизоотологический и эпидемиологический мониторинги для недопущения распространения этой смертельной инфекции.

Завозных случаев, связанных с распространением чумы, за годы независимости в Казахстане, по ее словам, не было ни разу.

– Были только свои, местные, с которыми мы уже научились бороться, – сказала она. – В Казахстане, напомню, есть своя противочумная вакцина, которая раз- работана и производится в стенах научного центра имени Масгута Айкимбаева.

Автор Индира САТБАЕВА

Статья опубликована в №91 от 01.08.2023 газеты «Вечерний Алматы» в рубрике «Суть всего живого».